Ein Aminosäuresequenzvergleich der Prionproteine von Mensch, Rind und Huhn

Roland Heynkes, 28. Februar 2001

Mensch  MANL  GCWMLVLFVATWSDLGLCKKRP KP GG WNTG GS R   YPGQGS
+ + + ++++++ +++ +++++++ ++ ++ ++++ ++ + ++++++
Rind MVKSHIGSWILVLFVAMWSDVGLCKKRP KP GGGWNTG GS R YPGQGS
+ + + + ++ + ++ ++ ++++ + ++ + ++ +
Huhn MARLLTTCCLLALLLAACTDVALSKKGKGKPSGGGW GAGSHRQPSYPRQ

Mensch PGGNRYP PQGGGGWGQPHGGGWGQPHGGGWGQPHGGGWGQ GGG
+++++++ +++++++++++++++++++++++++++++++++ +++
Rind PGGNRYP PQGGGGWGQPHGGGWGQPHGGGWGQPHGGGWGQ PHGGGWGQPH
++ ++ + + ++ + ++ + ++ + + + + ++
Huhn PG YPHNP GY PHNPGY PHNPGY PHNPGYPQNP GY PH

Mensch T HSQWNKPSKP KTNMKHMAGAAAAGAVVGGLGGY
+ + ++++++++ ++++++ ++++++++++++++++
Rind GGG GWGQG GT HGQWNKPSKP KTNMKHVAGAAAAGAVVGGLGGY
+ +++++ + + + ++ ++ +++ +++++++++++++++++++
Huhn NPGYPGWGQGYNPSSGGSYHNQ KPWKPPKTNFKHVAGAAAAGAVVGGLGGY

Mensch MLGSAMSRPIIHFGS DYEDRYYR ENMHRYPNQVYYRPMDEYSN QN
+++++++++ +++++ ++++++++ ++++++++++++++ + +++ ++
Rind MLGSAMSRPLIHFGS DYEDRYYR ENMHRYPNQVYYRPVDQYSN QN
+ + ++ ++ + + + + ++ ++++ ++++ + ++ +
Huhn AM GRVMSGMNYHFDRPD E Y RWWSENSARYPNRVYYR D YSSPVPQD

Mensch NFVHDCVNITIKQHTVTTTTKGENFT E TDVKMMER VV EQ
++++++++++ + +++++++++++++ + ++ +++++ ++ ++
Rind NFVHDCVNITVKEHTVTTTTKGENFT E TDIKMMER VV EQ
++ ++ ++++ + + + + + + + + ++ +
Huhn VFVADCFNITVTEYSIGPAAKK N TSEAVAARNQTEVEM ENKVVTKVIRE

Mensch MCITQYERESQAYYQRGSSMV LFSSPP VILLISF LIFLIVG
++++++ ++++++++++ + + ++++++ +++++++ +++++++
Rind MCITQYQRESQAYYQRGAS VI LFSSPP VILLISF LIFLIVG
++ ++ ++ + + ++ + + + + ++ + +
Huhn MCVQQY RE Y RLAS GIQLH PADTWLAVLLLLLTTL FAMH

Die Sequenzen von Mensch und Rind stimmen an maximal 227 Positionen überein. Bei einer Referenzlänge von 264 Aminosäuren sind dies 86,0% identische Aminosäuren. Die Sequenzen von Rind und Huhn stimmen an maximal 138 Positionen überein. Bei einer Referenzlänge von 267 Aminosäuren sind dies nur 51,7% identische Aminosäuren.

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