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Ein Aminosäuresequenzvergleich der Prionproteine von Mensch, Rind und Huhn

Roland Heynkes 28. Februar 2001, CC BY-SA-4.0 DE

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Mensch  MANL  GCWMLVLFVATWSDLGLCKKRP KP GG WNTG GS R   YPGQGS

        +     + + ++++++ +++ +++++++ ++ ++ ++++ ++ +   ++++++

Rind    MVKSHIGSWILVLFVAMWSDVGLCKKRP KP GGGWNTG GS R   YPGQGS

        +         + +  +   ++ + ++   ++ ++++  + ++ +   ++ +  

Huhn    MARLLTTCCLLALLLAACTDVALSKKGKGKPSGGGW  GAGSHRQPSYPRQ  



Mensch  PGGNRYP  PQGGGGWGQPHGGGWGQPHGGGWGQPHGGGWGQ   GGG     

        +++++++  +++++++++++++++++++++++++++++++++   +++     

Rind    PGGNRYP  PQGGGGWGQPHGGGWGQPHGGGWGQPHGGGWGQ PHGGGWGQPH

        ++   ++  + +      ++  +   ++  +   ++  +  + + +     ++

Huhn    PG   YPHNP GY     PHNPGY  PHNPGY  PHNPGYPQNP GY    PH



Mensch                  T  HSQWNKPSKP KTNMKHMAGAAAAGAVVGGLGGY

                        +  + ++++++++ ++++++ ++++++++++++++++

Rind    GGG  GWGQG     GT  HGQWNKPSKP KTNMKHVAGAAAAGAVVGGLGGY

          +  +++++     +   + +  ++ ++ +++ +++++++++++++++++++

Huhn    NPGYPGWGQGYNPSSGGSYHNQ  KPWKPPKTNFKHVAGAAAAGAVVGGLGGY



Mensch   MLGSAMSRPIIHFGS DYEDRYYR   ENMHRYPNQVYYRPMDEYSN   QN

         +++++++++ +++++ ++++++++   ++++++++++++++ + +++   ++

Rind     MLGSAMSRPLIHFGS DYEDRYYR   ENMHRYPNQVYYRPVDQYSN   QN

         + +  ++    ++   + +  + +   ++  ++++ ++++  + ++    + 

Huhn    AM GRVMSGMNYHFDRPD E  Y RWWSENSARYPNRVYYR  D YSSPVPQD



Mensch  NFVHDCVNITIKQHTVTTTTKGENFT E       TDVKMMER VV     EQ

        ++++++++++ + +++++++++++++ +       ++ +++++ ++     ++

Rind    NFVHDCVNITVKEHTVTTTTKGENFT E       TDIKMMER VV     EQ

         ++ ++ ++++ +       +  + + +       +   + +  ++     + 

Huhn    VFVADCFNITVTEYSIGPAAKK N TSEAVAARNQTEVEM ENKVVTKVIRE 



Mensch  MCITQYERESQAYYQRGSSMV  LFSSPP     VILLISF LIFLIVG

        ++++++ ++++++++++ + +  ++++++     +++++++ +++++++

Rind    MCITQYQRESQAYYQRGAS VI LFSSPP     VILLISF LIFLIVG

        ++  ++ ++   +  + ++  + +   +      + ++    + +    

Huhn    MCVQQY RE   Y  RLAS GIQLH  PADTWLAVLLLLLTTL FAMH

Die Sequenzen von Mensch und Rind stimmen an maximal 227 Positionen überein. Bei einer Referenzlänge von 264 Aminosäuren sind dies 86,0% identische Aminosäuren. Die Sequenzen von Rind und Huhn stimmen an maximal 138 Positionen überein. Bei einer Referenzlänge von 267 Aminosäuren sind dies nur 51,7% identische Aminosäuren.

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